Geneious

自动标注,实时序列分析和蛋白质结构预测

用我们全面的DNA序列编辑工具对您的序列充满信心。 编辑并注释序列,然后将您的作品导出为可发布的图像。

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使用自动注释很容易发现

根据公共或本地数据库中的现有模式和注释自动注释新基因组,包括将ORF注释为基于这些模式和基于NCBI的查询的假设基因。

  • 用ORF标注序列或用Glimmer预测基因
  • 通过复制和粘贴序列搜索图案
  • 基于相似性的注释(大型序列数据库)
  • 使用对齐方式传输注释
  • 用火卫一检测串联重复
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强大的SNP检测和变异调用

在美丽的浏览器中导航读取。 在序列查看器中手动轻松识别,检查和解决分歧,或快速注释较大重叠群上的变异。 该功能可以配置为

  • 通过查找高于最低阈值的分歧来屏幕读取错误。
  • 仅在编码区域找到分歧
  • 确定变异对蛋白质翻译的影响,包括仅密码子中第一个和第三个位置发生变化的变异
  • 计算SNP正确的概率
  • 消除高链偏倚的SNP
  • 将您的变体导出到csv
  • 搜索并注释短的结构变体,例如短串联重复序列(STR)和插入和删除事件(InDels)
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实时序列预测

只需点击几下,您就可以找到您的序列,包括:

  • DNA翻译   - 翻译和补充您的核苷酸序列。 一次翻译任何一帧或全部6帧,或者只是翻译您感兴趣的注释或选择。
  • 共有序列   -根据您选择的身份方案,其中包括在其上会自动选择最佳的基地呼叫色谱数据“以质量求共识”预测一致序列
  • DNA序列   - 预测身份,读取覆盖率,有关基本频率,残基频率,CpG岛等的众多统计数据
  • 蛋白质序列   - 预测分子量,等电点,疏水性,跨膜区域,卷曲螺旋区域,氨基酸电荷等

在Geneious中的自动标注

视频简介

中/英文教程

下载免费试用版和我们的其中一个教程,以交互方式掌握Geneious的功能。


教程 - 成对对齐

利用dotplots和比对算法开发将Gene和DNA序列对齐的技能。


教程 - 三维结构

探索Geneious 3D结构查看器中的控件,并学习如何使用它来可视化蛋白质结构中的活动网站。

 

应用笔记

在Geneious中创建SNP树

关于如何使用来自埃博拉病毒分离株的下一代测序数据在Geneious中生成SNPtree的概述。