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下载免费试用版和我们的其中一个教程,以交互方式掌握Geneious的功能。
教程 - De Novo组装拼接
了解如何执行短读取NGS数据的重新汇编,如何处理配对结束的数据,并根据参考序列检查装配的质量。
了解如何为下游分析组装和编辑色谱图。
该模块的目的是编辑和分析一些“原始”DNA序列数据,以确定野生动物法医病例中生物样本的来源。
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导入任何数据类型,解复用,修剪,过滤,汇编或映射到引用。
清洁数据对准确的下游分析至关重要。 通过利用所有必要的预处理工具,确保您的数据处于最佳状态:
不要在质量上妥协! 与其他常用映射算法相比,独特的Geneious Read映射器及其迭代方法可以产生出色的结果,并且可以正确对齐结构变体。 如果你需要一些不同的东西,Bowtie,TopHat和BBMap都可以在你的指尖中运行。
Geneious Assembler具有足够的灵活性,可处理来自任何类型测序仪的数据,并且可以读取任意长度的数据,包括来自不同测序仪的读取和混合读数。 对于产生圆形重叠群的独特能力的微生物组装尤其有益。 另外,运行MIRA,SPAdes,Tadpole(蝌蚪)或Velvet也同样容易,MAUVE基因组比对可以帮助您进行基因组比对和整理。
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该模块的目的是编辑和分析一些“原始”DNA序列数据,以确定野生动物法医病例中生物样本的来源。
在这项研究中,使用Geneious de novo 汇编 器从短阅读NGS序列数据组装两个线粒体基因组 ,并将结果与由Velvet,MIRA和SPAdes产生的组装进行比较。
De Novo细菌基因组序列拼接
Illumina MiSeq数据组装和注释细菌基因组的工作流程。
使用Geneious从短读数NGS数据集中重建一个完整的,循环的,注释的叶绿体基因组。
探索Geneious中的一条管道,该管道允许从疑似感染患者身上进行的高通量宏基因组数据中准确识别和分析低浓度ZIKV。